質譜儀圖的閱讀需要結合橫座標和縱座標的信息。具體來說：
橫座標：代表的是分子離子峯及碎片峯，這有助於判斷物質的分子量及可能的主要結構。例如，烯丙基、苄基等特徵峯可以幫助判斷化合物的結構。
縱座標：代表的是分子碎片的穩定程度，這有助於判斷碎片相近的物質區分。例如，通過質譜圖可以直接判斷二甲苯的三種構型，就是利用這個方法。
此外，質譜圖中的其他術語還包括：
質荷比(m/z)：離子質量與它所帶電荷的比值，用於表示離子的相對分子質量。
離子丰度：檢測器檢測到的離子信號強度，用於表示離子的相對濃度。
基峯：在質譜圖中，指定質荷比範圍內強度大的離子峯稱作基峯。
總離子流圖(TIC)：在選定的質量範圍內，所有離子強度的總和對時間或掃描次數所作的圖。
質量色譜圖：指定某一質量(或質荷比)的離子其強度對時間所作的圖。
準分子離子：在ESI中，往往生成質量大於分子量的離子如M+1,M+23,M+39,M+18等，表示爲:[M+H]+,[M+Na]+等。
碎片離子：準分子離子經過一級或多級裂解生成的產物離子。
同位素離子：由元素的重同位素構成的離子。
在閱讀質譜圖時，需要結合這些術語來全面理解化合物的結構信息。