賽爾號2講述了地球的一群勇敢的賽爾機器人，乘坐速度進入神秘的賽爾彼岸星進行科學探險的故事。在面對該星球突變生物和智慧精靈的時刻，他們勇往直前，尋找一船隊所說的神秘能量之源——神之石的傳說，以便給地球的混亂帶來復甦之力的故事。
在這個過程中，他們與卡蘭星人成為朋友，並一起對抗邪惡的索倫森，解放卡蘭星，拯救宇宙的故事。賽爾們勇敢的行動打動了精靈們，它們紛紛加入到隊伍中，共同對抗邪惡勢力。
在冒險的過程中，賽爾們不僅找到了傳說中的神之石，還發現了卡蘭星生命之樹瀕臨滅絕的危機。他們發現原來索倫森企圖將黑暗力量竊取到神之石中，導致卡蘭星生命的源泉枯竭。為了拯救卡蘭星和地球，賽爾們勇闖索倫森的秘密基地，並成功阻止邪惡計畫的實施。
總的來說，賽爾號2的故事是一個充滿冒險、友情、正義和拯救的故事。