《遊戲王》的故事線包括以下部分：
1. 本篇劇情主要圍繞著遊戲與海馬、城之內等人的友情故事展開。在故事中，玩家們通過卡片決鬥並肩作戰，共同對抗混沌黑暗的邪惡勢力。
2. 海馬篇：遊戲和海馬決鬥，通過決鬥卡片探索混沌戰士的記憶，並最終擊敗黑暗力量。
3. 埃及篇：遊戲和城之內與混沌黑暗的敵人展開決鬥，在決鬥中尋找混沌戰士的卡片並最終擊敗敵人。
4. 劇情後期，遊戲與海馬、恐龍龍崎等人一同對抗黑暗遊戲，最終決戰勝利後，遊戲成為了日本決鬥冠軍，並且和本鄉唯以及未來的大德寺大師成為好朋友。
此外，動畫中還有遊戲王劇場版第一季的劇情，主要圍繞黑暗決鬥、手札相剋、最強融合等故事情節展開。
以上就是《遊戲王》的主要故事線，故事中的許多人物和情節都對後續劇情產生了影響。