鱷龜的樣子具有一些獨特的特點，它們的頭部和頸部有許多肉突，給人一種獨特的感覺。鱷龜的背甲長而厚，呈棕褐色，上面有13塊盾片，形狀像13座小山連綿起伏，邊緣有許多鋸齒狀的突起。它們的舌頭異常獨特，長有紅色且分叉的蠕蟲狀肉突，這種構造使得鱷龜能夠模仿蠕蟲的動作，引誘魚類接近其口部。鱷龜的尾巴細長堅硬，像鋼鞭一般，長度約為背甲長的0.8倍。與其他龜類不同的是，鱷龜的頭部和四肢不能縮入殼內。在成長過程中，鱷龜的體型變化非常大，幼龜時期顏色近似黑色，背甲相對較窄，但隨著年齡的增長，背甲會變得寬圓，顏色也會由黑色逐漸轉變為以褐色為主。到了成年階段，鱷龜的頭部、身體和尾巴的比例大致相等。