製作酵素肥料的方法有多種，以下是其中一種常見的製作方法：
原料準備。需要準備果蔬廢棄物（如蔬菜、水果皮等）、糖（如白糖、紅糖、蜂蜜等）、水（自來水或井水）。
清洗果蔬廢棄物。將果蔬廢棄物徹底清洗乾淨，去除不可食用的部分，並將可食用的部分切成小塊。
混合原料。將切好的果蔬廢棄物放入大容器中，加入適量的糖和水，糖的用量約為果蔬廢棄物重量的10%，水的用量約為果蔬廢棄物重量的2到3倍。
發酵。將容器密封，放置在陰涼通風的地方，每天攪拌一次，發酵時間一般為3到6個月，具體時間取決於溫度和濕度等因素。
過濾和保存。發酵完成後，將酵素液過濾，去除固體殘渣，得到的純淨酵素液可放在密封容器中保存，保存時間可達半年以上。
此外，還可以添加如雞蛋殼、酵母等輔助材料，以增強酵素的發酵效果和肥效。每種製作方法的具體步驟可能略有不同，可以根據個人條件和需求進行適當調整。