醪糟的保存方法有多種，主要包括以下幾種：
冷藏保存。將醪糟放入密封容器中，然後放入冰櫃冷藏室。低溫可以減緩微生物的生長速度，延長醪糟的保質期。
冷凍保存。把醪糟放入密封袋中，擠出空氣後封口，然後放入冰櫃冷凍室。這種方法可以大大延長醪糟的保存時間，但解凍後應儘快食用。
真空保存。使用真空封口機將醪糟真空包裝，以減少氧氣對醪糟的影響，延長保存時間。
加熱殺菌。將醪糟加熱至沸騰，然後迅速冷卻，可以殺死大部分微生物，然後密封保存。
加入防腐劑。在醪糟中加入適量的食品級防腐劑，如苯甲酸鈉等，可以延長保存時間。
傳統方法。把發酵好的醪糟裝入玻璃瓶中，確保容器內不粘一點油，以避免變質。然後把裝好的醪糟放入鍋中，上面蓋層食品級塑膠膜，再蓋瓶蓋，快速擰緊，密封好後晾涼。
滅菌處理。先將醪糟包裝好，然後置於80℃的熱水中滅菌30分鐘，或者使用瞬時滅菌器滅菌。
紫外線燈管滅菌。在包裝的同時使用紫外線燈管進行滅菌。
在保存醪糟時，確保容器的密封性良好是非常重要的，以防止空氣和細菌進入，同時避免過度攪拌和移動醪糟，以保持其品質。此外，定期檢查醪糟的顏色、氣味和質地，確保沒有變質跡象。