金斗植被追殺的原因是多方面的。首先，金斗植原本的任務是刺殺金某，以破壞南北之間的緩和關係，但金某死於心臟病突發，導致金斗植消失。金斗植在完成任務後，被金某死前的言論所打動，出於人道主義精神，他選擇隱瞞自己的刺殺行爲，因此消失。
金某死後，北邊的繼任者知道了內情，想要追殺金斗植並報復南邊。爲了培養自己的異能者並爭取時間實現和平，北邊假意和平。南邊的閔次長得知消息後重新上位，而北邊在培養異能者成功後潛入南邊，但被發現並與九龍浦發生大戰，導致南北衝突重新激化。
此外，金斗植在超異能族第七集中遭到特工組織的追殺，爲了保護李美賢和兒子，他設計引開特工組織並與組織裏的三個異能者展開了激烈的打鬥，但最終被特工組織抓走。
綜上所述，金斗植被追殺的原因包括他完成了刺殺任務後的消失、他對南北衝突的人道主義立場、以及他在超異能族中的角色和行動。