陰陽師的主線故事主要圍繞著主人公安倍晴明和其式神們的冒險展開。
晴明是一位神秘的陰陽師，他藉助強大的式神來保護自己和友人，與惡勢力作鬥爭。故事中，他與各種妖怪、式神之間建立了深厚的情感紐帶，並不斷揭露陰謀、維護陰陽兩界的平衡。主線劇情中穿插著許多有趣的冒險、挑戰和事件，例如“禍津神之夢”、“山川妖怪的入侵”等等。這些事件不僅推動著主線發展，還展示了陰陽師的智慧和勇氣。
在故事的發展過程中，晴明的式神們一一登場，他們或忠誠或背叛或神秘或強大，為故事增添了許多精彩的元素。同時，主線故事中也涉及到了陰陽師們的生活、情感和成長，展現了陰陽師世界的多元性和豐富性。
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