《傾世皇妃》的結局是馥雅公主在經歷了複雜的情感和權力鬥爭後，最終選擇離開宮廷，與她深愛的祈佑在相思湖畔重逢。
全劇以馥雅公主的視角展開，講述了她與祈佑之間的愛情故事，以及她與弟弟度雲的權力鬥爭。在劇情的高潮部分，馥雅公主發現了度雲的真正面目，意識到他為了權力不擇手段，在度雲登基之際，馥雅公主親手用皇冠上的簪子刺死了他，為天下蒼生除了一害。隨後，馥雅公主將兵權交給了趙匡胤，讓他統一中原，自己則策馬揚鞭離去，來到了相思湖畔。
在湖邊，她聽到了熟悉的笛聲，走進竹林發現了祈佑，兩人攜手湖邊，實現了他們的約定。這個結局雖然充滿了悲劇色彩，但也傳達了一種對愛情和正義的堅持和追求。