顯宗和密宗在佛教體系中存在一些差異，主要體現在以下幾個方面：
傳承方式：顯宗和密宗在修行方法和目標上有所不同，但它們都屬於佛教體系，都追求解脫和覺悟。
經典：顯宗和密宗的經典有所不同，顯宗的經典如《大藏經》，而密宗的經典主要是《大日經》與《金剛頂經》等。
修行方法：顯宗以方便(法門)修行，積集兩資糧(福德和智慧)為因，通過修行十善法，以求得離苦得樂。而密宗則堅持二諦無別，把果當作道修行，道即果，果即道。
戒律：顯宗有菩薩戒根本十九條等，相對零散。而密宗戒律規定十分嚴格，凡是修煉密法者必須恪守三昧耶(以眾生原本有智慧德相為戒法)，清淨身、語、意，遠離不善。
饒益眾生的方式：顯宗注重生命，對眾生慈悲為懷。而密宗則有著具體而微的做法，以息災、增長、收攝、降伏諸法饒益眾生。
取得成果的時間：顯宗最短需要三個阿僧祇劫的時間，才能修成正果達到菩薩位。而密宗最短可以在現世即身成佛。
雖然顯宗和密宗在某些方面有所不同，但它們並非對立關係，而是互補關係。顯教為密教提供了基礎，密教則為顯教提供了更深入的修行方法。