飼料發黴的原因主要包括以下幾個方面：
水分含量過高。飼料中的水分如果超過安全水分（通常爲14%以下），黴菌就會在飼料中生長繁殖，導致飼料變質和發黴。
儲存條件不當。如果飼料儲存環境潮溼、溫度過高或通風不良，會加速飼料的變質和發黴。
飼料本身質量差。如果飼料含水量高、營養成分不均衡，容易受到黴菌和細菌的侵害，從而引起變質和發黴。
儲存時間過長。飼料儲存時間過長，容易受到空氣、溼度等因素的影響，從而引起變質和發黴。
污染。在飼料的生產、運輸、儲存等過程中，如果接觸到有害物質、細菌等，容易引起變質和發黴。
環境因素。黴菌的生長和繁殖需要一定的溫度和溼度條件。大部分黴菌適宜生長的溫度爲20～30℃，最適相對溼度爲80%～90%。在高溫高溼的環境中，如我國南方地區的梅雨季節，黴菌生長繁殖最爲旺盛。
生產過程中的問題。如原料自身帶有黴菌、水分控制不當、成品包裝密封性不好等，都可能導致飼料發黴。