馬桶的主要功能包括：
洗淨功能：包括臀部洗淨和女性洗淨，使用專用噴嘴噴出溫水進行清洗，有助於防止細菌感染。
洗淨位置調節：全自動馬桶可以根據不同使用者的體型自動調節洗淨位置，使用方便。
移動清洗：噴嘴在洗淨時可以前後往返移動，擴大清洗範圍，增強清洗效果。
按摩功能：在洗淨時，水壓會有節律變化，起到按摩作用，促進血液循環。
調節功能：包括自動加熱座墊，使便座座墊保持一定溫度，以及溫度調節，可根據個人喜好調節水溫、座溫和風溫。
暖風烘乾：馬桶能吹出舒適的暖風，使洗淨後的臀部乾燥爽快，風溫可調節。
自動功能：包括自動除臭、便座緩衝、自動感應、自動沖洗和噴頭自潔。
節電和安全功能：馬桶能根據使用時段電腦控制溫水和便座加熱，達到節電目的，還具備無線遙控功能。
此外，還有一些推薦功能和進階功能，如恆溫座圈、暖風烘乾、自動除臭、靜音緩降、離座沖水、腳踢沖水、男士小便功能、節電功能、夜燈功能、自動開合、自動感應翻蓋、雙噴嘴設計、座圈可拆卸、潤壁功能和用戶記憶功能等。智能馬桶的節水功能也比傳統馬桶更優越，通過微電腦控制系統精準控制沖洗水量，避免水資源浪費。