高能化合物主要包括以下幾種：
三磷酸腺苷(ATP)。這是細胞中最重要的高能化合物，在生物體中扮演着儲存、釋放和利用能量的關鍵角色。
磷酸肌酸。它作爲另一種重要的高能化合物，在肌肉和神經組織中尤其豐富。
磷酸烯醇式丙酮酸。它是一種在糖酵解過程中產生的高能化合物。
1,3-二磷酸甘油酸。它是一種在糖酵解和光合作用中發現的高能化合物。
乙酰輔酶A。它是一種在脂肪酸代謝中起到關鍵作用的高能化合物。
此外，還有胺甲酰磷酸、焦磷酸(PPi)、磷酸精氨酸、ADP等也是常見的高能化合物。這些化合物通過其特殊的高能磷酸鍵在生物體內傳遞和儲存能量，對於維持生命活動至關重要。