在《魔女之泉3》的二周目中，主要的挑戰是打敗泰瑪和小阿這兩個boss。為了打敗泰瑪，你需要擁有至少15000的法術強度，然後連續吃下5個精靈石，帶上盧克角色。使用盧克的同歸於盡技能和你的平A攻擊可以擊敗泰瑪。對於小阿，同樣需要15000的法術強度，連續吃下大約10個精靈石，然後使用技能和平A攻擊可以擊敗小阿，因為小阿的血量比泰瑪多。
關於刷精靈石，建議在冰霜洞穴、龍之谷和黑魔洞穴進行。刷怪應有順序，比如先打水精靈，然後是冰巨人、斯諾，接著是火精靈和它的小弟，最後是木精靈、黑騎士和閃電龍。這樣，當你刷冰霜洞穴時，水精靈刷新也會提醒其他怪物也刷新了。
此外，二周目中還有一些額外的支線任務和獎勵。例如，施內特線、純血神族線、監獄線、艾琳線、紅狐狸線等，這些任務將獎勵你新的武器、時裝、房子、全屬性加成和金幣等。
最後，建議使用以前的存檔來開啟二周目，因為新版本對以前的劇情進行了一些修改。你可以根據自己的喜好來決定是否重新開始。