黑枸杞的保存方法有多種，主要包括以下幾種：
塑膠袋真空保存法。將去除雜質的黑枸杞放入塑膠袋中，加入裝有生石灰的小痲袋，密封塑膠袋口並抽出空氣，然後放置在陰涼處存儲。使用此方法需定期檢查以防漏氣，同時注意生石灰的用量應視黑枸杞的含水量和其他情況而定。
冷藏法。將黑枸杞裝入保鮮袋，然後放入冰櫃或其他冷藏設備中，保持在0到4℃的溫度下保存。這種方法簡單實用，適合家庭使用。
避光和乾燥環境。將黑枸杞存放在乾燥、通風、陰涼的地方，避免陽光直射和高溫。這樣可以有效延緩黑枸杞的氧化和變質過程。
密封保存。將黑枸杞放入密封性好的容器中，如玻璃罐或塑膠密封袋，確保容器內乾燥，並儘量隔絕空氣和濕氣。
處理霉變。若黑枸杞發生霉變，可以通過搓散結塊，去除嚴重變質的部分，噴淋適量白酒濕潤表面，然後用微火焙乾並密封保存。
定期檢查黑枸杞的狀態，確保沒有發霉、變質或異味，對於保持其品質非常重要。正確的保存方法可以有效地延長黑枸杞的保質期。