《FF X2》的故事發生在前作《FF X》的數年後，主人公為庫羅蘭二世，與蒼天騎士一同討伐邪惡的魔王帝爾格雷茨與附屬獸，阻止他們發起革命並征服世界。不過隨著革命軍在不斷努力中實力大增，艾達公主在叛變前已經受制於魔王並危在旦夕。主人公的行動受到加爾巴赫和神聖騎士團團的阻止和阻止了古代維埃拉遺址的事件之後，被迫只能遠赴海之冠王國希望喚醒反攻帝國的海盜之力來彌補實力差距，阻止戰爭的到來。故事還有另一位關鍵人物塞菲里奧內斯國王繼承人卡羅琳，和在決戰前離家出走且因為幸運技能能改運勢和指引運勢強的人的劍魔伊弗列姆相遇並相知相愛。兩人分別幫助主角解決了帝國不斷發生的騷亂並都擁有不同的魔法與武器裝備來助其消滅危機以及喚醒失蹤在冰原之下身為強大的禁咒儀式的菲尼克斯埃爾塞諾而聯接場景變成無盡之塔帝國研究所與其他領域的高科技迷宮洞窟遺蹟群冰原之地並與封印維拉之上變為障礙連線道舊樂園廣野教會上空蔓延的瘴氣森林和森林內部隱藏著大量不死生物，而且因封印儀式解除還從廢墟中復甦出來的邪龍傑帕德，戰爭不斷升級和升級到其他區域等等戰鬥不斷升級的故事。但遊戲並沒有給出結局而是繼續下一部作品《FF X3》的故事。