FMS系統的含義取決於其應用的領域，可以指：
功能性動作系統(Functional Movement Systems)，主要用於體育和康復領域，包括功能性動作篩查(FMS)、選擇性功能動作評估(SFMA)、Y平衡測試(YBT)和基礎體能篩查(FCS)。
飛行管理系統(Flight Management System)，是現代客機的航空電子設備的基本組成部分，負責空中飛行計劃的管理。
柔性製造系統(Flexible Manufacturing System)，一種自動化製造系統，由數控加工設備、物料儲運裝置和計算機控制系統組成。
貨代管理系統(Freight Management System)，針對貨代行業特有的業務規範和管理流程開發的系統。