ISO9001流程主要包括以下幾個步驟：
運行三個月以上的時間。首先，需要按照檔案化的要求進行至少三個月以上的運作，以確保至少進行一次管理評審等工作，並逐步自我完善，做好相應機制的改革。
提出相應申請。向國家認可的機構提出ISO9001認證申請，簽訂相應的認證契約，確定好認證的範圍。審核前一個月，需要提交資料，包括申請書、質量手冊、營業執照、相關檔案等。
現場審核工作。ISO9001需要進行現場審核工作，包括提問、交談、現場觀察和檢測工作。完成現場審核並經過相應的申請確認後，就可以完成認證。
認證策劃階段。這個階段包括事前策劃、準備，結合企業現狀進行分析，明確企業9001認證的整體工作安排和目標。包括認證策劃、確定ISO9001認證範圍、現狀調查與風險評估。
體系建立。依據第一階段的準備情況和調研結果，制定ISO9001體系框架，編寫體系檔案，並監督體系運行及持續改進。
制定質量政策和目標。組織首先需要確定其質量政策和目標，明確對質量的承諾，並確保其與組織的使命和戰略目標相一致。
制定質量手冊。包含組織的質量管理體系結構和關鍵流程的概述，制定相關的程式和工作指導書，以規範各個質量管理過程的實施步驟和方法。
崗位職責和培訓。明確員工的崗位職責和責任，並提供必要的培訓，確保員工了解和遵守質量管理體系的要求。
實施過程控制。通過設立適當的過程控制措施，確保產品和服務在生產和提供過程中的質量要求得到滿足。
進行內部審核。定期進行內部審核，對質量管理體系進行評估，發現問題並採取糾正措施。