Ka/Ks比值是分子生物學中用來評估蛋白質編碼基因進化模式的一個重要指標。Ka代表同義突變數，即不改變胺基酸序列的突變數，而Ks代表非同義突變數，即改變胺基酸序列的突變數。Ka/Ks比值的生物學意義如下：
Ka/Ks >> 1：表明基因經歷了正選擇，即某些突變因為對蛋白質功能有利而被自然選擇保留下來。
Ka/Ks ≈ 1：表明基因沒有經歷明顯的選擇壓力，進化可能是中性的，或者說是由純化選擇決定的，即無害的突變被保留。
Ka/Ks << 1：表明基因经历了负选择或纯化选择，即大多数突变因为对蛋白质功能有害而被自然选择排除。
這個比值可以幫助研究者理解蛋白質編碼基因的進化模式，是分子進化生物學研究中的一個重要工具。