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kegg富集分析

KEGG富集分析(KEGG Enrichment Analysis)是一種生物信息學方法,主要用於研究差異基因集的基因功能和關鍵基因篩選。通過KEGG富集分析,可以了解目的基因參與了哪些生物通路和具有哪些功能,以及哪些通路可能對表型的變化起主導作用。例如,在維生素B6代謝通路中,可能有目的基因參與,通過KEGG富集分析可以識別這些基因。

KEGG資料庫是一個集合了基因組、化學和健康等信息的資源庫,它包含了大量手繪的代謝路徑圖和其他細胞與生物機能的數據。這些路徑圖展示了分子互動與反應的網路,反映了基因組內基因及其產物(主要是蛋白質)的過程。

富集分析的過程基於這樣的原則:如果某個生物過程發生異常,那麼具有共同功能的基因應該在該過程中顯示出更高的富集程度。富集分析可以通過使用統計方法如卡方檢驗Fisher精確檢驗超幾何分布二項式機率來進行定量分析,幫助研究人員確定感興趣生物現象的正確通路。

總之,KEGG富集分析是一種重要的生物信息學工具,它可以幫助我們理解基因在特定生物通路中的作用,從而為疾病診斷藥物研發等領域提供有價值的信息。