Mfuzz包是一種基於模糊c均值聚類（Fuzzy C-Means Clustering，FCM）的聚類方法，最初開發用於處理具有時間序列特徵的基因表達或蛋白表達譜數據。它的核心目的是分析基因或蛋白表達的時間趨勢，並通過聚類具有相似表達模式的分子，幫助理解這些生物學分子的動態模式及其與功能的聯繫。Mfuzz不僅能夠識別表達譜的潛在時間序列模式，還能通過聚類相似模式的基因來揭示基因的動態模式和它們的功能聯繫。此外，Mfuzz還提供了繪圖功能，能夠繪製時間序列，清晰地展現基因表達的動力學特徵。
雖然Mfuzz包最初是為基因和蛋白表達數據分析設計的，但它也可以用於其他類型的生物學或非生物學數據的聚類分析，甚至在「其它非時間梯度」的情形下也有套用。例如，有研究使用Mfuzz對胚胎蛋白質的動力學模式進行了分析，並進一步討論了這些蛋白質群的豐度變化及其功能，如通過基因集富集分析和蛋白網路分析等方法。
總結來說，Mfuzz包是一個強大的工具，它通過模糊c均值聚類算法，能夠在時間序列數據中識別和解析基因或蛋白的表達模式，從而為生物學研究提供深入的見解。