在PS2版的聖鬥士星矢遊戲中，控制聖鬥士移動是通過十字鍵或左遙桿實現的。輕攻擊可以通過□鍵連續形成連擊，而重攻擊可以通過X鍵連續形成連擊並可能破防。當小宇宙槽增加至一條之後，可以通過○鍵發動必殺技巧，當小宇宙槽增加至三條後，可以按住蓄力，當旁邊的燈亮了之後可以發動強有力的BIGBANG ATTACK。每個角色的攻擊次數和BIGBANG ATTACK數目都不等。衝刺可以通過△鍵實現，而被敵人打飛之後可以用此鍵受身。L1鍵用於雜兵戰切換目標，R1鍵用於防禦。遊戲中還有瞬間防禦、第七感、女神的呼喚等系統。模式方面，黃金十二宮模式是青銅聖鬥士突破黃金聖鬥士的包圍，拯救雅典娜的故事，而千日戰爭模式則可以隨意選擇聖鬥士對戰。
挑戰副本在遊戲中主要產出聖鬥士碎片，而主線副本則產出大量聖鬥士經驗藥水和挑戰卷。經驗藥水可以提升聖鬥士等級，消耗挑戰卷可進入挑戰副本。和其他玩家組隊進入副本可獲得額外的組隊收益加成。