RNA提取的原理主要涉及使用變性劑如Trizol試劑來破碎細胞或組織，促使核蛋白體的解離，從而使RNA與蛋白質分離，並釋放到溶液中。隨後，通過離心和有機溶劑（如酚、氯仿）的抽提，RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開來。在這一過程中，Trizol試劑中的成分如苯酚和硫氰酸胍有助於細胞裂解並保持RNA的完整性，同時使蛋白質和RNase酶失活，從而防止RNA降解。
在離心後，RNA主要存在於水相中，而DNA和蛋白質則主要留在有機相中。通過異丙醇沉澱和水相轉移，可以進一步純化RNA。最後，通過洗滌RNA沉澱並溶解在無RNA酶的水中，獲得純淨的RNA。