修剪水草的方法多種多樣，具體取決於水草的種類和生長狀態。以下是一些常見的修剪方法：
修葉法。適用於連作生的水草和蕨類水草，主要是修剪老葉、下層葉以及殘缺不全的葉片，確保每片葉子都能接受到光線。
分株法。適用於葉片過多並且從根部已經分裂成多箇植株的水草，一年進行一次。
打頭髮。適用於插莖類水草，可以修剪水草並讓水草生長更茂盛。
間株法。適用於生長過於茂盛的莖類水草，可以讓植株擁有寬闊的生長空間。
剪枝法。適用於水草茂盛、根部錯綜複雜的情況，剪除過長的枝杈和生長不良的枝杈。
掃邊法。適用於莫斯類水草，修剪周邊蔓延的枝葉。
切薄法。適用於莫斯類水草，修剪薄一點有利於透光。
摘心法。適用於珍珠草、爵牀類等，去掉頂端的頂芽，使其向兩側生長。
留莖去根法。適用於頂端葉片豐富美麗但莖下半截葉片稀少的水草，將莖類水草沿根剪切不留任何根部，然後將莖插入水中重新生長根。
在進行修剪時，應使用專門的水草剪刀，避免使用手直接摘掉或拔掉水草。修剪後，應將剪下的枝葉撈出，以保持水族箱的清潔。在修剪設計時，可以考慮使用田野尚的方法，在缸壁外畫出預修剪的樣子，沿線修剪。使用合適的工具進行修剪，如在修剪前景使用波浪剪刀，中後景使用彈簧剪。在修剪過程中，最好繼續開啓過濾系統，以避免水質污染。