木瓜泡酒的最佳配方有多種，以下是一些常見的配方：
基礎配方。選擇新鮮成熟的木瓜，洗淨後切成圓片，包括表皮和種子。然後，將木瓜片與米酒和砂糖一起放入玻璃瓶中，密封放置在陰涼處保存。這種藥酒需要至少保存半年，理想情況下保存一年以上。
簡易配方。將木瓜洗淨，去皮後切成小塊。使用42度清香型小曲糧食酒，按照木瓜到酒到冰糖1:0.3:1的比例進行浸泡。將配好的木瓜、冰糖和白酒放入無鉛玻璃瓶中，密封後放置在陰涼避光處，大約15天後即可飲用。
高級配方。選擇500克鮮木瓜，40克石菖蒲，40克九月菊，60克桑寄生，20克小茴香，以及5000毫升無添加泡酒專用糧食酒。將這些藥材切成薄片或搗碎，放入潔淨的布袋中，再浸入糧食酒中，密封浸泡7天後即可飲用。
這些配方都以木瓜為主要成分，但通過調整配比和添加不同的藥材或酒精度數，可以製作出不同風味和功效的木瓜酒。