枸杞的加工方法主要有以下幾種：
曬乾法。這是最傳統的乾燥方法，包括使用鹼水攪拌新鮮採摘的枸杞，然後在陰涼處晾曬兩天，讓其失去部分水分，此過程應避免直接陽光和手動翻動，以防果實變黑，接著將枸杞移至陽光下繼續曬乾，通常需要十天左右。曬乾後的枸杞應及時裝入雙層特製的口袋中，並密封以防止返潮。
烘烤法。這種方法適用於大規模生產，首先需要搭建一個小的烘乾房，房內安裝風扇，生火保持溫度在大約60至70攝氏度，將枸杞放入烘乾房的支架底層，隨著枸杞水分減少，逐漸將其移至上層，此方法可以快速乾燥枸杞，但可能會影響其顏色和營養價值。
風乾法。適用於少量枸杞的加工，將枸杞放在通風良好的陰涼處自然晾乾，避免直接陽光照射。
凍乾技術。這是一種現代技術，涉及在低溫下將枸杞冷凍並使用真空環境去除水分，這種方法最大程度地保留了枸杞的營養和風味，同時避免了傳統晾曬或烘乾可能導致的營養流失。
除了上述物理加工方法，還有對枸杞進行炮製的步驟，例如將枸杞在鍋中用文火炒至黃色並略帶焦點，以改善其口感和藥性。這些加工方法不僅關乎枸杞的最終質量，還影響其保存時間和營養價值。