洋蔥容易受到多種病害的影響，其中一些常見的病害包括：
洋蔥銹病。葉片上出現零星的小泡點，後發展成圓形、橢圓形或梭形小斑，病斑表皮開裂後散出橙黃色或紫褐色的粉末。
洋蔥霜霉病。主要危害葉片和花梗，病斑呈黃白色或乳黃色，濕度大時病斑表面遍生灰白色絨霉。
洋蔥白腐病。葉片和花梗出現水漬狀的小白點，後期變成褐色或暗紫色的病斑。
洋蔥疫病。葉尖開始發黃褪綠，形成水浸狀的病斑。
洋蔥灰霉病。葉片出現大面積的乾尖，濕度大時病部長出灰色霉層。
洋蔥黑斑病。葉片和花梗出現黃綠色斑狀，嚴重時葉片枯萎或倒伏。
洋蔥軟腐病。從心葉或側葉開始軟爛，最後倒伏並有惡臭。
此外，洋蔥還可能受到蟲害的影響，如根蛆、潛葉蠅和蔥薊馬等。這些蟲害和病害都可能對洋蔥的生長和產量造成嚴重影響。