清洗羊肚菌的方法根據其新鮮度有所不同，具體如下：
新鮮羊肚菌。首先使用流動的自來水沖洗羊肚菌，以去除表面的泥土和雜質，可以順著一個方向輕輕攪拌或打圈，以幫助清除表面和內部孔隙中的髒物。新鮮羊肚菌通常不需要泡發，只需在清洗過程中確保徹底清除泥沙。
乾羊肚菌。首先使用自來水快速沖洗乾羊肚菌，以去除表層的灰塵和雜質，然後將其浸泡在40到50度的溫水中，水量應足以覆蓋羊肚菌，浸泡時間約為20到30分鐘，直到羊肚菌變軟，浸泡後的羊肚菌可以用手輕輕攪動，以幫助去除泥沙，然後再次用清水沖洗，直到清洗乾淨。
需要注意的是，在清洗羊肚菌時，應避免使用過熱或過冷的水，因為這可能會影響其口感和香味的散發。此外，泡發羊肚菌的水可以保留並沉澱泥沙後用於烹飪，以充分利用其營養價值。