蓋玻片的清洗方法取決於其使用情況和污染程度。以下是幾種常見的清洗方法：
普通清洗。使用洗潔精或肥皂水，將蓋玻片浸泡一段時間後，用清水沖洗乾淨，然後使用乾淨的紗布或綢布擦拭乾淨，並放置在通風處晾乾。
中度或重度污染清洗。對於中度或重度污染的蓋玻片，可以使用重鉻酸鉀酸性洗液或鹽酸乙醇洗液進行清洗，這些清洗液能有效清除有機物、無機污物及黴斑，清洗後，用雙蒸水沖洗，以置換掉自來水中的雜質，然後用100%酒精浸泡，最後用乾淨的紗布擦乾，如果需要無菌條件，應進行高壓消毒。
需要注意的是，清洗蓋玻片時應小心操作，避免用力過猛導致蓋玻片碎裂。