《三劍奇緣》是一部融合了玄幻和武俠元素的劇集，講述了文武狀元史天雲接受特殊使命的故事。史天雲必須尋找日、月、人三劍，以防止它們落入敵手，從而避免對國家造成危害。在這個過程中，史天雲邂逅了流浪到中原的波娜娜姑娘，並與之發展了一段感情。同時，意歡公主也對史天雲情有獨鍾，這使得史天雲陷入了情感的糾葛之中。劇集還描繪了史天雲與叛敵殷不凡及其同謀之間的正義與邪惡的搏鬥。此外，劇中引入了大量的電腦特技，創造出神奇獨特的場景，爲觀衆帶來了視覺上的享受。
劇情還涉及到天界的元素，講述了錢塘潮神因貪杯醉酒而在凡間引發災難，最終被南海觀音平息並打入凡間的故事。太陽星君和太陰星君因此結下不解之緣，並隨之下凡降伏妖孽，解救蒼生。史天雲（太陽星君轉世）和波娜娜（太陰星君轉世）的前世情緣也在劇情中得到了延續。