三聖菇可以在神奧地區的心齊湖、立志湖和睿智湖中找到。以下是具體的捕捉地點和步驟：
黃聖菇：
捕捉地點：睿智湖中的睿智洞窟。
捕捉方法：在結束珍珠獸或鑽石獸的事件後，直接前往睿智洞窟捕獲。
藍聖菇：
捕捉地點：立志湖中的立志洞窟。
捕捉方法：在結束珍珠獸或鑽石獸的事件後，前往立志洞窟捕獲。
紅聖菇：
捕捉地點：心齊湖中的心齊洞窟。
捕捉方法：與紅菇對話後，全地圖飛行，定位到地點後飛過去在草叢中尋找。建議晚上使用黑暗球以提高捕獲率。
額外提示：
在主任務21湖泊的石板進行中時，可以前往心齊湖、立志湖以及睿智湖捕獲三聖菇。
完成天冠山山頂的銀河隊主線劇情後，可以去神奧地區的三大湖捕捉三聖菇。
在捕捉過程中，建議靈活運用噴霧器來遇敵捕捉，並且不要盲目飛行，以免重新定位導致難以找到寶可夢。