三清殿有兩個地點，具體如下：
位於木府：
位置：位於木府的中軸線上，依山而矗立，是木府最高的建築。
特點：可以俯瞰整個大研古城。
歷史：原是建在玉音樓旁，幾經毀壞，在1996年麗江地震的重建中修建在木府後花園獅子山上。
供奉：殿內供奉道教三清佛像，中爲玉清原始天尊，左爲太清道德天尊，右爲上清靈寶天尊。
文化：是木氏土司推崇道家精神的產物，在木氏土司廨舍建築羣中。
位於福建省莆田市：
地址：具體位置爲福建省莆田市城廂區荔城大道199號。
特點：是一座古老的道教廟宇。
以上信息提供了關於三清殿的兩個不同地點及其特點的詳細描述。