人芽囊原 蟲是一 種寄生 蟲，其形 態 結 構多 樣，主要 包括以下 幾 種 類型：
空泡型： 這是人芽囊原 蟲的典型形 態， 蟲 體呈 圓形或卵 圓形，直 徑 約 為6至40微米，但多 數 為4至15微米。 蟲 體中央有 一個 較大的空泡，核呈月牙 狀或 塊 狀， 數目 為1至4 個。 這 種 類型的 蟲 體在碘染色下呈棕 黃色，中心 體呈空泡 狀。
顆粒型：由空泡型 發展而 來， 蟲 體中心 內充 滿 圓形 顆粒 狀物 質， 這 種形 態在培 養基中血清含量高 時 較 為常 見。
阿米巴型：外形多 變，具有 偽足突起，能 夠 進行 緩慢移 動。胞 質中含有 細菌或 顆粒 狀物 質， 這 種形 態的 蟲 體在腹 瀉水 樣便中 較 為常 見。
復分裂型：含有多 個核，核 與核之 間有胞 質相 連， 這 種 類型的 蟲 體通 過二分裂和孢子增殖的方式 進行繁殖。
包囊型：被 認 為是感染期，呈 圓形或卵 圓形，直 徑 約 為2至5微米，囊壁厚 約5至10微米。
人芽囊原 蟲可以侵入 腸 黏膜上皮， 並在人 體 腸道 內致病， 導致患者出 現腹 瀉、腹 脹、 厭食、 噁心、 嘔吐等症 狀， 嚴重 時甚至可能出 現 發 熱寒 戰等。免疫功能正常的患者多 數情 況下 為自限性，病程通常 為1至3天。