基差風險是指保值工具（如期貨）與被保值商品（現貨）之間價格波動不同步所帶來的風險。
基差，即現貨成交價格與交易所期貨價格之間的差額，這個差額不是固定的。基差的波動會給套期保值者帶來無法迴避的風險，直接影響套期保值效果，尤其是當使用替代品種進行保值時。基差風險的大小和影響因數包括基差水平、變化趨勢以及套期保值平倉對沖的時間。例如，在理論上，期貨價格等於現貨價格加上持有成本，如儲存成本、保險成本、資金成本和損毀等。如果這些持有成本發生變化，基差也會隨之變化，從而影響套期保值組合的損益。
此外，當使用的期貨合約標的資產與被套期保值的風險資產不一致時，如交叉套期保值情況，基差風險更大，因爲兩者的價格變化基本因素不同。在套期保值組合持有期間，由於基差可能不斷擴大或縮小，因此會使套期保值組合產生損益。