基礎研究和應用研究是科學研究中的兩種基本類型，它們在目的、方法和應用方面有所不同。
基礎研究是指爲獲得新知識而進行的創造性研究，主要針對自然科學和社會科學的理論基礎，研究各種事物運動形式的基本規律。它的主要任務是尋求各種事物發展變化的規律，發現新事實、新規則、新原理，或是探索某一類實際問題的理論基礎。基礎研究旨在認識世界，增加科學知識，不必考慮研究成果能否付諸實踐或者能在何處付諸實踐。這類研究通常在學科前沿進行，並不着眼於當前的應用或特定的商業目的。
應用研究則是以基礎科學爲理論武器，研究實踐中提出的各種具體的科學技術問題。它的目的是改造世界，解決特定的實際問題，爲實踐者提供實際有用的知識。應用研究具有直接的實際應用價值，解決某些特定的實際問題或提供直接有用的知識。它主要是用於應用或檢驗理論，評價其在解決實際問題中的作用。
基礎研究與應用研究的劃分有時是相對的，它們常常互爲補充。基礎研究提供解決教育問題的理論，應用研究提供事實材料去支持和完善理論，或促進新理論的產生。在應用研究過程中，往往需要基礎理論研究補充現有知識的缺陷。如果應用研究只限於解決當前具體問題，而不企圖從基礎研究角度探究其根本原理，那麼所得到的結果可能只會解決局部問題，而不能得到廣泛應用。