施肥的時間取決於植物的種類、生長階段以及土壤條件。以下是不同情況下施肥的推薦時間：
春季。在春季種植前，應給土壤施基肥，這通常是在土壤解凍後，大約在春季開始生長前。
生長期。對於生長季節的植物，如玉米、水稻、小麥、大豆、油菜和馬鈴薯，施肥時間主要在生長旺盛期，例如玉米在拔節後、水稻在返青後、小麥在三葉期、大豆在初花期等。
特定作物。對於特定作物，如果樹，施肥時間也因品種和生長階段而異。例如，蘋果樹在發芽前應追施速效無機氮素肥料，而在生理落果後至果實迅速膨大期，以及果實採收後施用基肥。
蔬菜。對於蔬菜，如番茄、辣椒和茄子，應在結果後及時追肥，生長正常的秧苗在第一個果實坐住後就可以追施。
此外，施肥的最佳時機還與土壤條件有關，例如，使用化肥的最佳時機通常是在陰雨天前，早晨和傍晚爲最佳施肥時間，因爲此時土壤潮溼，化肥能更好地溶解並吸收。