《仙劍奇俠傳五》的故事劇情圍繞著五個主角：男主角“雲天河”、女主角“韓菱紗”、女主角“柳夢璃”、男配角“紫英”以及“懷朔”。他們為了尋找五靈珠和妖界勢力對抗，在尋找過程中，他們經歷了許多冒險和挑戰，包括與敵對勢力戰鬥、解開各種謎題、面對自己的內心等等。
雲天河在故事中逐漸成長，從一個普通的獵戶成長為一個真正的英雄，他與女主角韓菱紗和柳夢璃之間的感情糾葛也是故事的一個重要線索。同時，五靈珠的秘密也逐漸揭開，揭示了一個更加廣闊的仙俠世界。
整個故事劇情充滿了緊張刺激的戰鬥、感人至深的情感以及各種謎題的解開，給觀眾留下了深刻的印象。