伊蘇9的故事主要圍繞著伊蘇國的勇士亞爾貝特展開。在遊戲中，他與他的妹妹卡蓮一起探索伊蘇王國，以尋找恢復王國光明的辦法。他們面對的是由黑暗巫師薩滿布洛涅所領導的邪惡勢力，他們試圖利用菲娜之盾的力量將伊蘇國引向毀滅。玩家將與亞爾貝特一同在戰鬥中成長，利用劍、魔法和神聖武器擊敗敵人，最終與菲娜一起揭示真相，打敗黑暗巫師布洛涅。遊戲的劇情十分豐富，涉及到親情、友情和愛情等多個主題，同時也有許多感人至深的情節。在遊戲過程中，玩家需要與其他NPC進行互動，解鎖新的任務和場景，同時也要面對各種難度的戰鬥和謎題。除了主線故事之外，遊戲還有許多支線任務和角色故事線可以探索，為玩家提供豐富的遊戲體驗。