胚胎停育的原因可能包括多種因素，主要可以歸納為以下幾類：
內分泌失調。胚胎早期發育需要足夠的雌激素、孕激素和絨毛膜促性腺激素等激素，母體激素水平不足可能導致胚胎停育。
子宮異常。包括子宮內環境不佳、子宮形態異常（如子宮縱隔、子宮肌瘤等），以及子宮內膜的問題（如太薄或太厚），這些都可能影響胚胎著床和發育。
染色體異常。夫妻雙方染色體異常或胚胎染色體異常，可能導致胚胎不健康，進而引起胚胎停育。
免疫因素。母體對胎兒的免疫排斥，可能是由於自身免疫型或同種免疫型問題引起的，例如抗磷脂綜合症或其他自身免疫抗體。
感染因素。孕期受到特定病毒（如皰疹病毒、巨細胞病毒、弓形蟲）或細菌感染，可能導致胚胎發育不良。
生活方式和環境因素。如長期熬夜、抽菸、酗酒、接觸有害物質（如X射線、重金屬等），以及生活工作壓力過大等，都可能增加胚胎停育的風險。
此外，還包括藥物中毒、呼吸道阻塞、離子紊亂等因素。這些因素可能單獨或協同作用導致胚胎停育，具體情況需要結合個體情況進行評估。