優酪乳中的乳酸菌含量通常很高，根據國家標準，每克優酪乳中的乳酸菌數不得低於100萬CFU（菌落形成單位）。實際測試顯示，不同品牌的優酪乳產品中乳酸菌含量差異較大。例如，明治保加利亞式優酪乳（清甜原味）的乳酸菌含量最高，達到3.4×10^9 CFU/mL，而簡醇0添加蔗糖風味酸牛奶的乳酸菌含量最低，為2.2×10^8 CFU/mL，這仍然符合國家標準並高出220倍。
另外，經過巴氏殺菌熱處理的風味發酵乳樣品中乳酸菌總數檢測結果均小於1000 CFU/mL，這表明經過熱處理工藝後，該類樣品中的乳酸菌已失去活性，以便於常溫保存。
總體來看，冷藏優酪乳的乳酸菌含量平均值為34.7145億CFU/g，遠高於國家限量要求的100萬CFU/g。