公務員加班費的計算方式主要依據工作時間的不同而有所區別，通常有以下幾種情況：
在日標準工作時間以外延長工作時間的加班費。公務員在標準工作時間以外延長工作時間的加班費，通常按照不低於小時工資基數的150%支付加班工資。
在休息日工作的加班費。公務員在休息日工作的，應當優先安排補休，如果不能安排補休，則按照不低於日或者小時工資基數的200%支付加班工資。
在法定休假日工作的加班費。公務員在法定休假日工作的，應當按照不低於日或者小時工資基數的300%支付加班工資。
需要注意的是，公務員加班無“加班費”規定，而是通過補休或津貼、補助等形式進行補償。