六祖惠能的真身現在供奉在廣東省韶關市的南華寺內的六祖殿。
南華寺是一座歷史悠久的寺院，位於韶關市曲江區馬壩東南7公里的曹溪之畔，距離韶關市南約22公里。六祖惠能大師得到五祖衣鉢後，繼承了東山法脈並建立了南宗，弘揚"直指人心，見性成佛"的頓教法門。他曾在南華寺講述曹溪禪法，死後肉身不腐，因此真身被供奉在南華寺內。雖然六祖惠能是廣東雲浮新興人，但他的真身並未被安放在故里，而是選擇了南華寺作爲歸宿。廣東地處亞熱帶，氣候炎熱潮溼多雨，不利於肉身保存，因此六祖真身能夠保存至今實爲奇蹟。
此外，也有傳說認爲六祖大師聖蹟安放在廣東省佛山市南海區寶蓮禪寺內，但並未得到證實。