切片染色方法有多種，主要包括：
蘇木精-伊紅染色法。這是一種常用的石蠟切片染色方法，蘇木精能使細胞核呈紫藍色，伊紅則使細胞質和細胞外基質成分呈紅色，這種方法有助於區分不同類型的細胞和組織。
免疫組化染色法。這種方法利用抗原抗體反應，通過化學反應使標記抗體的顯色劑（如螢光素、酶）顯色，從而確定腫瘤內的抗原（多肽和蛋白質），用於特定蛋白或抗原的檢測和定位。
特殊染色。針對特定類型的組織或疾病進行染色，例如鐵染色、骨質染色、神經醯胺酶染色等。
血液學染色。如吉姆薩染色(Giemsa)、Wright染色等，主要用於血液病學檢查。
油紅O染色。用於脂肪細胞和中性脂肪的組織學染色。
Orcein染色。適用於B型肝炎表面抗原(HBsAg)的組織學染色。
這些方法的選擇取決於需要診斷的疾病類型和組織的類型。例如，淋巴瘤的診斷可能需要免疫組化染色法，而結核病的診斷則可能使用抗酸染色。