北京交通卡的退卡流程主要分為兩種情況：
對於可以正常使用的卡片，包括外觀完好無損的卡片，可以在北京市政一卡通的125個指定網點辦理退卡業務，這些網點可以通過「北京市政交通一卡通」公眾號查詢。退卡可以通過自助設備進行，退卡後押金和卡內餘額會轉回掃碼支付的微信賬戶，以現金形式當場退回。
對於損壞的卡片，如完全折斷或有明顯裂痕的卡片，需在45個指定網點辦理退卡業務，這些網點的信息也可以通過「北京市政交通一卡通」公眾號查詢。對於人為損壞的卡片，押金不予退還，卡內餘額將在10個工作日內打入預留的銀行卡賬戶。
此外，每人每次最多可以退5張卡，如果卡片消磁或損壞，需攜帶身份證和一張銀行卡。如果卡內餘額是負數，將從押金中扣除補上。在自助設備上無法識別卡內餘額的情況下，可以在人工視窗識別並現金形式退還押金和餘額。