南京有多個地方可以品嘗到美味的糯米藕，根據搜尋結果，以下兩家店鋪被特別推薦：
楊家冰糖蜜汁藕
地址：瑞金路6號，位於瑞金路菜市場正門口。
特點：楊家的藕以其糯嘰嘰的口感著稱，切的時候軟乎乎地趴下，附贈的蜜汁香濃稠密。藕軟爛一些，糯到融化的感覺，被認為是南京第一家蜜汁藕。價格方面，9塊能買到半斤，藕軟爛一些，糯到融化的感覺。
三七八巷的蜜汁藕
地址：位於夫子廟大市場對面三七八巷內。
特點：這裡的藕很大，量也很足，是九孔藕，煮的軟糯而又不爛。重頭戲是鹵藕，熬鹵三個小時，煮好的藕放進滷汁里還需要再鹵三個小時。相比於瑞金路的那家，這家更韌一些，藕真的是藕斷絲連，比較厚重的拉絲感。軟糯香甜中帶著一份脆韌，香甜對比兩家都好吃。
綜上所述，根據搜尋結果，楊家冰糖蜜汁藕 和 三七八巷的蜜汁藕 被認為是南京最好吃的糯米藕。您可以根據自己的口味偏好選擇前往其中一家品嘗。