在《口袋妖怪黑2》的二周目中，玩家 將 經 歷一系列新的冒 險和挑 戰，以下是 詳 細的攻略：
劇情 發展。玩家 會遇到 紅豆杉博士的父 親，他 會 幫助玩家升 級 圖鑑至全 國 圖鑑。之 後，玩家 會遇到 勁 敵和他的妹妹，得知 一個 關於索 羅 亞克在冠 軍之路等待玩家的 夢。此外， 遊戲 會添加新的壁 紙。
探索矢 車森林和七 寶市。玩家需要 前往 飛 雲市，通 過天箭之 橋到 達矢 車森林，在 那裡 會遇到切林， 並 與切林一起 調查等 離子 團的 蹤 跡。在矢 車森林外 圍的 試 煉之岩，可以 讓 隊伍中的 格鬥系PM打出星之砂，每天一次。在七 寶市，玩家可以 與副 館 長 參 觀博物 館，或 與 蘆 薈、 亞堤、 亞坤三人回 憶 與暗之三位一 體交 戰的 劇情。
挑 戰三曜市道 館。在三曜市，玩家可以 與天桐、伯特、寇恩三人 進行 雙打 對 戰，每天一次。 從三曜市向右 來到 夢之 跡地，玩家 會遇到拉迪 歐斯或拉帝 亞斯， 並 與它 們 發生 戰鬥。
挑 戰黑色摩天 樓。黑色摩天 樓共有10 個地 區，每 層都有 門 衛和 層主。在 頂 層，玩家 會遇到阿迪克的 孫子， 並 與他 進行一 場 戰鬥。
收集特殊道具和 訓 練 師交流。二周目中 還有 許多 隱藏任 務和特殊道具等待玩家 發 現。完成 這些任 務可以 獲得更 強大的口袋妖怪和 獎 勵。 與其他 訓 練 師的交流和 對 戰也是二周目的重要部分。
捕捉神 獸。玩家需要 前往源初之山的山洞，打 敗 薩坦精 靈和其他Boss，最 終 進入冠 軍之路，挑 戰 聯盟。
此外，在三曜市向下 來到1 號路，如果 與黑白 進行 過 聯 動， 會有 一個NPC告 訴玩家 關於前作主角的故事。