合金裝備的故事可以追溯到冷戰時期，當時美國和蘇聯之間的緊張關係使得世界處於核戰爭的邊緣。合金裝備故事的主要背景是一個名為“ Metal Gear”的秘密武器，它被設計為能夠控制整個國家。主角4代中的主角小富是MGS4中主人公的孫子，他繼承了祖父的遺志，繼承了“合金裝備”並開始了一段新的冒險。
小富在冒險中遇到了各種敵人，包括恐怖分子、政府官員和國際犯罪組織。他必須使用他的智慧和勇氣來克服這些敵人的挑戰，同時還要面對自己的內心掙扎和道德困境。在故事中，小富必須證明自己是一個值得信賴的領袖，帶領他的團隊走向勝利。
除了主線故事外，合金裝備系列還包括許多支線任務和角色故事，這些故事提供了更多的背景信息和人物關係，使得整個故事更加豐富和有趣。整個合金裝備的故事主題圍繞著勇氣、智慧、背叛和忠誠等元素展開，使得這個系列成為了一個備受玩家喜愛的遊戲系列。