咖啡發黴通常是由一種叫做“黃麴黴”(Aspergillus flavus)的真菌引起的。這種黴菌在潮溼、溫暖的環境中繁殖，當咖啡豆遭受過度潮溼的情況下，很容易就被黃麴黴污染。由於咖啡天然含有油脂，這也爲黃麴黴的繁殖提供了良好的營養環境。一旦咖啡受到污染，黃麴黴就會在咖啡豆表面形成白色細長的毛狀物。
此外，咖啡豆在儲存過程中，如果接觸水分，也會發生髮黴。水分不僅會讓咖啡豆發黴，更重要的是，它還會摧毀咖啡豆中的咖啡油，從而破壞咖啡的品質和風味。因此，爲了保障食品安全，建議在購買咖啡時應選擇新鮮的、沒有發黴跡象的咖啡豆，同時在儲存咖啡時儘可能保持乾燥、通風的環境，避免咖啡長時間接觸潮溼的環境。