嗶哩嗶哩被稱為B站的原因主要有：
嗶哩嗶哩這個詞來源於動漫《某科學的超電磁炮》中女主角御坂美琴的綽號。在與擁有將一切力量化為烏有的男主對戰時，御坂美琴用硬幣打出電氣系技能超電磁炮，電流所發出的聲音被調侃為「bilibili」，此後男主給御坂美琴起了個綽號叫「bilibili」。而嗶哩嗶哩網站以bilibili命名，是為了向《某科學的超電磁炮》這部動漫致敬，大家為了方便稱呼就簡稱為B站。
B站是由A站資深用戶徐逸所建。他創建B站的原因是當時的A站內部發生了矛盾，所以現在我們所熟悉的B站在2009年6月26日建立，全稱則叫嗶哩嗶哩。