圓形魚缸的過濾可以通過以下幾種方式進行：
氣泡式過濾器。這種過濾器利用氣泡推動水流進行過濾，對水質影響較小，特別適合小型魚缸。由於圓形魚缸的特殊設計，氣泡式過濾器可以節省空間，不會對小型魚的繁殖造成壓力。
底部過濾器。底部過濾器使用濾材對水進行過濾，特別適用於圓缸養魚的設計。建議選擇重力自然流的濾水方式，以保持水清潔。安裝時應選擇水流分佈均勻的位置，避免死水區的產生，並確保過濾器與空氣泵不同時安裝在同一位置。
自制過濾器。例如，使用脈動飲料瓶製作過濾器。首先在瓶口打幾個小孔以增加出水流量，防止溢流。然後剪掉瓶底，塞入一層層濾材，如硝化菌球、過濾棉和硝化菌環。這種過濾器簡單且成本低，適合放在上過濾盒的出水口進行二次過濾。
此外，定期更換過濾物、清洗過濾器、控制魚食量以及加入活性碳等物質也是維護水質的重要措施。